Ile liekanos šoninės grandinės optiniai izomerai ================================================ Izoleucinas (Ile, https://en.wikipedia.org/wiki/Isoleucine) yra viena iš tų aminorūgščių (a.r.), kurios turi asimetrinį atomą ne tik pagrindinėje grandinėje (Cα), bet ir šoninėje grandinėje (kur?). Taigi, jei dauguma a.r., pavyzdžiui leucinas (Leu), turi tik du optinius izomerus (L-Leu ir D-Leu), tai Ile turi jų daugiau (kiek?). Klausimai: - kiek PDB archyve yra baltymų struktūrų su įvairiais optiniais Ile izomerais? - ar Ile Cα atomo optinė konfigūracija koreliuoja su šoninės grandinės optine konfigūracija, ar jos "kombinuojamos" atsitiktinai? Kodėl? - Kokie PDB archyve sutinkami *reti* Ile optiniai izomerai? Kodėl jie atsirado šiose PDB struktūrose? Ar tai PDB klaidos, ar įdomūs gamtos reiškiniai? Ar laukinėje gyvojoje gamtoje šie izomerai bus sutinkami? Programa: Šiam tyrimui reikalinga programa, kuri skaito PDB archyvo failus ir nustato bei išveda Ile liekanų optinę konfigūraciją.